Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp7Q60973 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp7Q60973 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms