Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DbpQ60925 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms