Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms