Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf8Q60846 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms