Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa3Q60790 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa3Q60790 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms