Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfaip3Q60769 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfaip3Q60769 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms