Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms