Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4a4Q5YIR8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms