Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabl6Q5U3K5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms