Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brip1Q5SXJ3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms