Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms