Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc85aQ5SP85 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85aQ5SP85 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms