Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynaQ5G5D5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms