Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp22Q5DU02 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp22Q5DU02 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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