Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms