Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf354cQ571J5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms