Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf608Q56A10 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf608Q56A10 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms