Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5935Q497S0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5935Q497S0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms