Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt35Q497I4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms