Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim26Q3V460 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim26Q3V460 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms