Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms