Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms