Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms