Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TceancQ3US16 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TceancQ3US16 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TceancQ3US16 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms