Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms