Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem253Q3UNB8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms