Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp30Q3UN04 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms