Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rmdn3Q3UJU9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rmdn3Q3UJU9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rmdn3Q3UJU9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rmdn3Q3UJU9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms