Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms