Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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