Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms