Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttll12Q3UDE2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll12Q3UDE2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms