Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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