Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LcorlQ3U285 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms