Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tatdn3Q3U1C6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms