Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc9Q3U0M1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms