Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hace1Q3U0D9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms