Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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