Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3TTJ4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3TTJ4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms