Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms