Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms