Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms