Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnnm3Q32NY4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm3Q32NY4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms