Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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Shroom4Q1W617 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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Shroom4Q1W617 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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Shroom4Q1W617 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shroom4Q1W617 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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