Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms