Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli2Q0VGT2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms