Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms