Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms