Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms