Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf1Q07802 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms